拥有过目不忘能力的少年医圣柯齐眉，因厌烦交际失踪三年，在“阅微草堂”药店打杂，独对店主晏沁洁的《青囊遗册》感兴趣，却被秦草视作情敌，展露中医知识后又遭秦师傅敌视。他先治好上吊妇女，应晏沁洁之邀参加中医集会一鸣惊人。会上西医屡屡羞辱中医，柯齐眉自曝身份使其铩羽而归。恰逢杭城首富女儿病重，西医束手无策，柯齐眉略施小计治愈患者，西医狼狈认输。最终他获得《青囊遗册》，继续发扬中医、攻克绝症。